このバージョンからオプションに「ポップアップ広告」 というのが追加され、これが有効になっているとSleipnir でBookmarklet を使う(2) で書いたBookmarklet が使えなくなることが判明。
「ポップアップ許可URLリスト」 にURL を書けば回避できますが(実験済み)、このBookmarklet の性格上、ページのタイトルとURL は普通毎回変わるわけで、ワイルドカードとか正規表現とかその辺の類の指定も出来そうにないので、少なくとも現時点ではこの機能をオフにすることでしか対処法はなさそうです。
せっかくある機能を使わないのはもったいないけど、この手のポップアップ広告は今のところ「禁止URL」 と「禁止タイトル」 でほぼまかなえているのでとりあえずこれで。